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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
07/02/2019 |
Data da última atualização: |
19/12/2019 |
Autoria: |
HEBERLE, H.; MEIRELLES, G. V.; SILVA, F. R. da; TELLES, G. P.; MINGHIM, R. |
Afiliação: |
HENRY HEBERLE, ICMC/USP; GABRIELA VAZ MEIRELLES, Laboratório Nacional de Biociências, Campinas; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; GUILHERME P. TELLES, IC/Unicamp; ROSANE MINGHIM, ICMC/USP. |
Título: |
InteractiVenn: a web-based tool for theanalysis of sets through Venn diagrams. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Bioinformatics, v. 16, p. 1-7, 2015. |
DOI: |
10.1186/s12859-015-0611-3 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 169. |
Conteúdo: |
Abstract. Background: Set comparisons permeate a large number of data analysis workflows, in particular workflows in biological sciences. Venn diagrams are frequently employed for such analysis but current tools are limited. Results: We have developed InteractiVenn, a more flexible tool for interacting with Venn diagrams including up to six sets. It offers a clean interface for Venn diagram construction and enables analysis of set unions while preserving the shape of the diagram. Set unions are useful to reveal differences and similarities among sets and may be guided in our tool by a tree or by a list of set unions. The tool also allows obtaining subsets? elements, saving and loading sets for further analyses, and exporting the diagram in vector and image formats. InteractiVenn has been used to analyze two biological datasets, but it may serve set analysis in a broad range of domains. Conclusions: InteractiVenn allows set unions in Venn diagrams to be explored thoroughly, by consequence extending the ability to analyze combinations of sets with additional observations, yielded by novel interactions between joined sets. InteractiVenn is freely available online at: www.interactivenn.net. |
Palavras-Chave: |
Diagrama de Edwards-Venn; Diagrama de Venn; Edwards-Venn diagram; Interaction; Set-unions; Venn diagram. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/192316/1/AP-InteractiVenn-Felipe-2015.pdf
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Marc: |
LEADER 01970naa a2200265 a 4500 001 2105705 005 2019-12-19 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/s12859-015-0611-3$2DOI 100 1 $aHEBERLE, H. 245 $aInteractiVenn$ba web-based tool for theanalysis of sets through Venn diagrams.$h[electronic resource] 260 $c2015 500 $aArticle number: 169. 520 $aAbstract. Background: Set comparisons permeate a large number of data analysis workflows, in particular workflows in biological sciences. Venn diagrams are frequently employed for such analysis but current tools are limited. Results: We have developed InteractiVenn, a more flexible tool for interacting with Venn diagrams including up to six sets. It offers a clean interface for Venn diagram construction and enables analysis of set unions while preserving the shape of the diagram. Set unions are useful to reveal differences and similarities among sets and may be guided in our tool by a tree or by a list of set unions. The tool also allows obtaining subsets? elements, saving and loading sets for further analyses, and exporting the diagram in vector and image formats. InteractiVenn has been used to analyze two biological datasets, but it may serve set analysis in a broad range of domains. Conclusions: InteractiVenn allows set unions in Venn diagrams to be explored thoroughly, by consequence extending the ability to analyze combinations of sets with additional observations, yielded by novel interactions between joined sets. InteractiVenn is freely available online at: www.interactivenn.net. 653 $aDiagrama de Edwards-Venn 653 $aDiagrama de Venn 653 $aEdwards-Venn diagram 653 $aInteraction 653 $aSet-unions 653 $aVenn diagram 700 1 $aMEIRELLES, G. V. 700 1 $aSILVA, F. R. da 700 1 $aTELLES, G. P. 700 1 $aMINGHIM, R. 773 $tBMC Bioinformatics$gv. 16, p. 1-7, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Registros recuperados : 12 | |
2. | | SHUHAMA, I. K.; NUNES, W.; FREITAS, L. A.; OLIVEIRA, W.; CERDEIRA, A. L.; UETA, J. Adsorptividade de solos da microbacia do Córrego do Espraiado, Ribeirão Preto: riboflavina como modelo de adsorção. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 21., 1997, Caxambu. Resumos. Viçosa: SBCPD, 1997. 482p. ref.368. p.368Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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4. | | ROCHA, A.; COSTA, F. M.; MIZUNO, C.; SHIHANA, J.; CERDEIRA, A. L.; UETA, J. Influência de matéria orgânica, pH e umidade sobre a população microbiana de solos incubados com atrazina e 2,4-D. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIENCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 21., 1997, Caxambu. Resumos. Vicosa: SBCPD, 1997. 482p. ref.361. p.361Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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5. | | ROCHA, A.; COSTA, F. M.; SHUHAMA, I. K.; CERDEIRA, A. L.; UETA, J. Caracterização sazonal do efeito de atrazina e 2,4-D sobre microrganismos de solos da microbacia do córrego do Espraiado, Ribeirão Preto-SP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 21., 1997, Caxambu. Resumos. Viçosa: SBCPD, 1997. 482p. ref.362. p.362Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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6. | | COSTA, F. M.; ROCHA, A.; MIZUNO, C. S.; SHUHAMA, I. K.; CERDEIRA, A. L.; UETA, J. Soils from microbasin of Espraiado, Ribeirão Preto City, Brazil: evaluation of microbial population from soil suspensions incubated with atrazine and 2,4-D Les sols du microbassin de Espraiado, Ribeirao Preto, Brésil : évaluation de la population microbienne de suspensions de sols incubées avec l'Atrazine le 2,4-D. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 16., 1999,Montpellier, France. Proceedings...Montepellier, France, 1999, CD Rom Symposion 7, Scientific Registration 1388, p. 1-7.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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7. | | ROCHA, A.; COSTA, F. M.; SHUHAMA, I. K.; CERDEIRA, A. L.; UETA, J. Effects of 2,4-D and atrazine on microbial population of different soils from a sugarcane plantation area. In: CONGRESS OF PHARMACEUTICAL SCIENCES, 1., 1997, Ribeirao Preto, SP. Bolletino Chimico Farmaceutico, v.136, p.192, 1997. Abstract.Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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8. | | CERDEIRA, A. L.; LANCHOTE, V.; GOMES, M. A. F.; BONATO, P.; PESSOA, M. C. P. Y.; SHUHAMA, I.; UETA, J. Herbicide residues in soil and water from sugar cane area in Brazil. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 16., 1998, Paris. Resumo. URL: http://www.cirad.fr/cgi-bin/radigon. 1998.Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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9. | | CERDEIRA, A. L.; LANCHOTE, V. L.; QUEIROZ, R. C.; BONATO, P. S.; GOMES, M. A. F.; PESSOA, M. C. P. Y.; UETA, J. Herbicides residues in soil and water from sugarcane area in Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUSTAINABLE AGRICULTURE IN TROPICAL AND SUBTROPICAL HIGHLANDS WITH SPECIAL REFERENCE TO LATIN AMERICA, 1998, Rio de Janeiro. Abstracts. Rio de Janeiro: INT / EMBRAPA-CNPS / University of Karlsruhe, 1998. 7 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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10. | | CERDEIRA, A. L.; SANTOS, N. A. G.; UETA, J.; SHUHAMA, I. K.; PESSOA, M. C. P. Y.; SMITH JUNIOR, S.; LANCHOTE, V. L. Atrazine in water and biodegradation in a recharge area of Guarany Aquifer in Brazil. Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, New York, v. 73, n. 1, p. 117-124, 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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11. | | PESSOA, M. C. P. Y.; CERDEIRA, A. L.; GOMES, M. A. F.; NEVES, M. C.; SOUZA, M. D. de; QUEIROZ, R. H. C.; LANCHOTE, V. L.; UETA, J. M. Screening models and system simulation applied to risk assessment of water contamination by herbicides in sugarcane cultivation area: Case study in the Espraiado Creek Watershed. In: GOMES, M. A. F. (Ed.). Agricultural use of the Guarani Aquifer recharge areas in Brazil: implications for groundwater and proposed agri-environmental schemes. Brasília, DF: Embrapa, 2012. pt. 2, p. 166-184. 1 e-book no formato epub.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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12. | | PESSOA, M. C. P. Y.; CERDEIRA, A. L.; GOMES, M. A. F.; NEVES, M. C.; SOUZA, M. D. de; QUEIROZ, R. H. C.; LANCHOTE, V. L.; UETA, J. M. Modelos screening e simulação de sistemas aplicados à avaliação de risco de contaminação da água por herbicidas em área de cultivo de cana-de-açúcar: estudo de caso na microbacia do córrego do Espraiado. In: GOMES, M. A. F. (Ed.). Uso agrícola das áreas de afloramento do Aqüífero Guarani no Brasil: implicações para a água subterrânea e propostas de gestão com enfoque agroambiental. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2008. p.235-261.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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